Основная часть населения православные. Примерно 67% жителей относятся к Македонской православной церкви. Эта церковь объявила о своей независимости от Сербской православной церкви еще в 1967 году, но до нынешнего времени независимость не признает ни одна православная церковь мира. Помимо православных в стране проживает немало мусульман – их около 30%. Еще 36% это приверженцы иных конфессий. На территории страны действуют как православные храмы, так и мечети, правда, первых гораздо больше по численности.
